A bonsai eset�n a talajfelsz�n feletti gy�kerek az idõskor �s stabilit�s �rzet�t keltik. Legjobb, ha a gy�kerek a t�rzstõl minden ir�nyban kiterjednek, azonban nem felt�tlen�l fontos, hogy az szimmetrikus legyen.
 A bonsaiok t�rzse - ak�r a term�szetben - lehet egyenes, ferde, g�rbe vagy osztott. A legfõbb k�vetelm�ny a t�rzzsel kapcsolatban, hogy az �tm�rõje a cs�cs fel� haladva fokozatosan cs�kkenjen. Az alap vastags�ga az idõs kor l�tszat�t kelti. A t�rzs vastags�g�nak illeszkednie kell a fafaj jelleg�hez.
 Egy fa k�rvonal�nak legfõbb szerkezeti eleme az �grendszer. Az �gak elhelyezked�s�nek egyens�lyban kell lennie. Az elsõ �g nagyj�b�l a t�rsz egyharmad�n�l helyezkedjen el, az oldal�gak lehetõleg a t�rzstõl kifel� indulva fokozatosan v�konyodjanak el. A bonsaif�kat �ltal�ban k�p alak�ra szokt�k metszeni. A cs�cs k�zel�ben l�võ �gak sûrûbben helyezkedjenek el.
 A legt�bb bonsait �gy alak�tj�k ki, hogy szembõl mutassanak j�l. Csak a fa felsõ harmad�ban legyenek elõre n�võ �gak. A cs�csot mindig �gy alak�tsuk ki, hogy a szeml�lõ fel� hajoljon. Fontos m�g, hogy a bonsai m�rete ar�nyban �lljon a levelek nagys�g�val.