A jap�n bonsai fa r�szei: a f�gy�k�r, mell�kgy�kerek, a t�rzs, vessz�k �s �gak, levelek �s a r�gyek. A gy�k�rrel (az er�teljesebb, vastagabb) kapaszkodik a fa a f�ldben, a mell�kgy�kerek, melyek a gy�kerek utols� 10 cm-es szakasz�n vannak, (hajsz�lgy�kerek) a v�z �s t�panyagfelv�teln�l van nagy szerep�k, illetve a oxig�nfelv�teln�l, ugyanis a gy�kerek is l�legeznek. Nagyon fontos, hogy a bonsai sose legyen pang� v�zzel teli ed�nyben, mert �gy a gy�kerek nem tudnak l�legezni. Ezut�n k�vetkezik a gy�k�rnyak, mely a gy�k�rzet �s a t�rzs k�z�tti r�sz, majd a t�rzs, melyet k�v�lr�l el�regedett h�ncsr�teg bor�t. Ez v�di a fatestet a k�rtev�kt�l �s az id�j�r�si viszontags�gokt�l. Ezut�n pedig az �gak, vessz�k, levelek �s r�gyek k�veteznek.